Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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HOPXQ9BPY8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOPXQ9BPY8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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