Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF4Q99607 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms