Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms