Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMA16Q96EY4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms