Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG2BQ96BY7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG2BQ96BY7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms