Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RB1CC1Q8TDY2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms