Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFRP1Q8N474 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms