Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8N402 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8N402 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8N402 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8N402 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8N402 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8N402 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q8N402 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q8N402 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q8N402 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms