Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGSM1Q2NKQ1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGSM1Q2NKQ1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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