Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms