Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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