Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CA9Q16790 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CA9Q16790 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CA9Q16790 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CA9Q16790 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CA9Q16790 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CA9Q16790 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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