Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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