Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL19A1Q14993 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms