Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBX1Q14549 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms