Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AP3B2Q13367 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms