Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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SRSF6Q13247 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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