Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2AQ12879 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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