Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms