Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF5Q12774 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms