Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM27E3Q08E93 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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