Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNB2Q08289 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms