Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CXCL9Q07325 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms