Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK3Q00526 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms