Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms