Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms