Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SH3BGRP55822 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BGRP55822 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BGRP55822 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms