Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CRIP1P50238 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms