Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF6P49848 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF6P49848 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF6P49848 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF6P49848 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF6P49848 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms