Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1DP48730 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms