Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-FP30511 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-FP30511 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms