Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FGFR3P22607 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms