Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAGEC1O60732 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms