Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RGPD3A6NKT7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms