Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LRRD1A4D1F6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms