Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F8A0AVK6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms