Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TTF2Q9UNY4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms