Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTNNA3Q9UI47 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms