Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTNNAL1Q9UBT7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms