Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD5Q99717 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms