Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGF29Q96ES7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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