Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHFRQ96EP1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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