Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF248Q8NDW4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms