Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYBPQ8N488 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms