Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PNMA8AQ86V59 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms