Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z407

CSMD3, CUB and sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD3Q7Z407 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CSMD3Q7Z407 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms