Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms