Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDZK1Q5T2W1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms