Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PERM1Q5SV97 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms