Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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